L’UMR est constituée de 3 équipes :

Génétique et Amélioration de la Vigne
L’équipe "Génétique et amélioration de la vigne" (GAV), animée par Didier Merdinoglu, a pour objectif général d'étudier le génome de la vigne afin de développer des stratégies d'amélioration génétique des cépages pour leur résistance aux maladies, leur régularité de rendement et leur adaptation aux conditions climatiques septentrionales. Le contrôle et le maintien du potentiel de qualité organoleptique du raisin est un objectif qui accompagne ces différentes voies de progrès génétique. L’équipe est constituée de généticiens et de pathologistes.

Virologie & Vection
L'équipe "Virologie & Vection" (ViVe) comprend des virologues et des entomologistes. Ses travaux portent sur l'étude des virus de la vigne et de la transmission de virus par des vecteurs invertébrés ('vection') et s'organisent autour des deux thèmes :
- Virologie de la Vigne (animateur Olivier Lemaire) : résistance de la vigne au court-noué, composantes du pouvoir pathogène des virus de la maladie du court-noué, variabilité et épidémiologie moléculaire de l'enroulement de la vigne, vection de virus par nématodes et par cochenilles, étiologie et méthodologie de la détection;
- Vection des polérovirus (animatrice Véronique Brault) : mécanismes moléculaires et cellulaires de l'interaction puceron-plante, recherche de partenaires végétaux et aphidiens de la particule virale, et étude de leur rôle dans la transmission du virus par puceron.

Métabolisme Secondaire de la Vigne
L'équipe "Métabolisme secondaire de la vigne" (MSV), animée par Philippe Hugueney met en oeuvre des stratégies de génomique fonctionnelle pour aborder deux axes de recherche :
- l'étude du rôle du métabolisme secondaire de la vigne dans les mécanismes de défense naturels contre les organismes pathogènes, et en particulier contre Plasmopara viticola, l'agent du mildiou;
- l'étude de la biosynthèse des arômes de la baie de raisin, déterminants importants de la qualité des vins.